Deuxième volet de la série de jeux de combat en 2D Marvel vs. Capcom. Il utilise le même format d'équipe que celui utilisé dans X-Men vs. Street Fighter. Chaque joueur sélectionne 2 personnages qui s'affrontent en 2 contre 2. Au lieu du format typique du meilleur des 3 rounds, les matchs se composent d'un seul round. Au début du match, le 1er personnage sélectionné est contrôlé par le joueur, tandis que le 2nd reste hors champ et sert de soutien. Les personnages ont des barres de vitalité séparées, et le personnage dormant récupère lentement sa barre de vitalité pendant que l'autre personnage se bat. Si l'un des personnages perd toute sa vitalité, son partenaire le remplace automatiquement dans le jeu. Le match se poursuit jusqu'à ce que les deux personnages de chaque équipe soient vaincus. Si le chronomètre se termine avant qu'une équipe ne soit éliminée, le joueur ayant le plus de points de vie restants combinés est déclaré vainqueur.