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L'intrigue se déroule au 22e siècle et tourne autour d'un dispositif connu sous le nom de "Time-Lock", une découverte faite sous les ruines de l'Égypte ancienne, appartenant à une civilisation encore plus ancienne mais technologiquement avancée, les Siriens. Cependant, cette découverte attire l'attention d'une dangereuse entité cosmique connue sous le nom de Notorious Mental, qui prend d'assaut l'Égypte et s'empare de la Time-Lock, abusant de ses pouvoirs pour créer une horde de bêtes clonées empruntées à divers points et lieux de l'histoire de l'univers pour se déchaîner sur la Terre. Plusieurs tentatives pour reprendre l'Egypte et atteindre la Serrure Temporelle ont échoué, jusqu'à ce qu'un nouveau groupe de travail soit envoyé, avec à son bord le "Serious" Sam Stone, qui, bien que séparé de son équipe, va de l'avant avec toutes les armes qu'il peut trouver.
